U skladu sa Zakonom o uplatama na jedinstveni račun i raspodjeli prihoda (Službeni glasnik BiH, broj 55/04), Pravilnikom o uplaćivanju indirektnih poreza i ostalih prihoda i taksi koje naplaćuje Uprava za indirektno oporezivanje (Službeni glasnik BiH, broj 89/05 i 76/06) i Pravilnikom o određivanju iznosa rezerve na Jedinstvenom računu za izmirivanje obaveza u vezi sa indirektnim porezima od strane Uprave za indirektno oporezivanje (Službeni glasnik BiH, broj 59/04), Uprava za indirektno oporezivanje je u periodu 01.01. - 31.12.2006.godine vršila prikupljanje prihoda na jedinstveni račun UIO, kao i raspodjelu sredstava sa jedinstvenog računa korisnicima.
Za razliku od prošle 2005.godine, ovu godinu je karakterisalo uvođenje PDV-a, što je donijelo značajan rast prihoda od indirektnih poreza koji su distribuirani svim korisnicima.
Ovako značajn rast prihoda od indirektnih poreza ostvaren je zbog visokog priliva prihoda od PDV-a u 2006. godini, a što je rezultat: sistemskih faktora i prednosti sistema PDV-a u odnosu na porez na promet, više stope PDV-a od prihodovno neutralne, jačanja finansijske discipline obveznika i efikasnosti rada Uprave za indirektno oporezivanje BiH.
Dobar udio prihoda ostvaren je i po osnovu  jednokratnih efekata: širenje porezne baze obuhvatom velikog broja obveznika i smanjenje poreznih utaja po tom osnovu, kao i suspenzije povrata obveznicima koji nisu pretežni izvoznici.

I Naplata prihoda

Prikupljanje prihoda vršeno je putem tri grupe računa otvorenih kod jedanaest komercijalnih  banaka, koje su sljedećeg radnog dana vršile prijenos prikupljenih prihoda na jedinstveni račun UIO otvoren kod Centralne banke BiH.

Analiza naplate prihoda u odnosu na plan za 2006. i izvršenje u 2005. godini:

• Ukupni naplaćeni prihodi (Iznos ukupno naplaćenih  pihoda od 4.469.378.720,14 KM su prihodi naplaćeni putem komercijalnih banaka koje čine sistem jedinstvenog računa - neto gotovinski tok jedinstvenog računa) na jedinstveni račun za period 01.01.- 31.12.2006.godine iznose 4.469.378.720,14 KM, što je u odnosu na plan (3.508.020.000,00 KM) više za 27,40% (tabela broj 2),
• Plan za 2006.godinu (3.508.020.000,00 KM)  je ispunjen polovinom mjeseca novembra,
• Ako se iznos koji je naplaćen na jedinstveni račun (4.469.378.720,14 KM) umanji za iznos svih realiziranih povrata  (341.845.711,37 KM) onda su ti prihodi u odnosu na plan za 2006.godinu veći za 17,66%, (tabela 2a),
• Iznos neto naplaćenog PDV-a/poreza na promet (2.496.565.397,91 KM) je u odnosu na plan (1.938.197.221,88 KM) veći za 28,81%, (tabela 2a),
  Ako posmatramo prikupljene prihode po vrstama najveći udio u indirektnim porezima i do sada je imao porez na promet, a uvođenjem PDV-a i smanjenom mogućnošću poreznih utaja taj udio je i povećan, odnosno naplata PDV-a/poreza na promet u 2006. godini brže je rasla od naplate ukupnih indirektnih poreza, tako da u ukupnim indirektnim porezima učestvuju sa 63,39% (grafički prikaz tabele broj 2a).
• Prihodi po osnovu naplate akciza porasli su za 7,57% u odnosu na plan  (tabela 2a),
• Kod prihoda po osnovu naplate carinskih dažbina zabilježen je pad za 6,70% u odnosu na plan, uglavnom zbog potpisanih sporazuma o slobodnoj trgovini, pada cijena nafte na svjetskom tržištu i smanjenog rasta uvoza u 2006. godini (tabela 2a),
• Neusklađeni prihodi (Neusklađeni prihodi su svi oni prihodi koji su naplaćeni na jedinstven račun, ali za koje još uvijek ne postoje analitička evidencija po vrstama prihoda razvrstanih u pomoćnim knjigama Uprave /PDV, carine, akciza/) na dan 31.12.2006. godine iznose 25.750.303,36 KM (tabela broj 1 i 2a) i isti su uvršteni u sumu ukupno raspoređenih prihoda u skladu sa odlukama Upravnog obora u 2006. godini, ali s obzirom da njihova struktura nije poznata ovaj iznos nije uzet u obzir u  poređenjima naplate indirektnih poreza po vrstama u odnosu na plan za 2006. godini.

II Raspodjela prikupljenih prihoda

Raspodjela prihoda u toku 2006.godine vršena je uz niz poteškoća, sa pet blokada jedinstvenog računa, jer UO UIO nije uspio usaglasiti koeficijente za raspodjelu prihoda.
Prihodi prikupljeni na jedinstveni račun su raspoređivani korisnicima prihoda po  koeficijentima koje je utvrdio UO UIO, tako da je iznos od 4.455.884.939,38 KM (tabela broj 3 i 4), prenešen korisnicima prihoda, kako slijedi:

• Na račun minimalnih rezervi izdvojeno je sredstava u iznosu od 444.130.739,98 KM, od čega je za povrat obveznicima rezervirano sredstava u iznosu od 346.709.202,85 KM, tako da neto prihodi za raspodjelu korisnicima prihoda iznose 4.025.247.980,16 KM, što je u odnosu na plan više za 14,74% (tabela  broj 2),
• Institucije BiH iznos od 566.000.000,00 KM,
• Federacija BiH iznos od 2.253.438.141,62 KM, od čega se na vanjski dug odnosi iznos od 166.758.500,00 KM i doznaku na račun budžeta Federacije BiH – iznos od 2.086.679.641,62 KM,
• Republika Srpska iznos od 1.069.995.346,27 KM, od čega se na vanjski dug odnosi iznos od  103.748.200,00 KM i doznaku na račun budžeta Republike Srpske – iznos od  966.247.146,27 KM,
• Brčko Distrikt iznos od  122.320.711,51  KM, od čega se na vanjski dug odnosi iznos od  11.000,00 KM i doznaku na račun budžeta Brčko Distrikta – iznos od 122.309.711.51 KM.

III Povrati sa jedinstvenog računa

• Povrati PDV-a
  U skladu sa zakonskim odredbama pravo na povrat PDV-a u roku od 30 dana od dana podnošenja PDV prijave imali su obveznici kod kojih je izvoz prelazio 30% ukupnog prometa u prethodnoj godini.. Ostali obveznici imali su pravo na porezni kredit koji se mogao koristiti kao akontacija za buduća plaćanja. Izmjenama Pravilnika o primjeni Zakona o porezu na dodanu vrijednost (Pravilnik objavljen u »Službenom glasniku BiH« broj 60/06 - avgust 2006. godine) omogućena je ubrzana isplata poreznih kredita poreznim obveznicima u drugoj polovini 2006. godine što je dovelo do rasta iznosa povrata na mjesečnom nivou od 11 miliona u martu do 66 miliona u novembu 2006. godine. Tako je Uprava izvršila povrat PDV-a obveznicima u 2006. godini po osnovu 36.213 rješenja u iznosu od 310.979.566,03 KM (tabela broj 2).
  Uprava je također, shodno važećoj zakonskoj regulativi u 2006. godini, vršila povrate PDV-a međunarodnim organizacijima i diplomatsko-konzularnim predstavništvima u iznosu od 22.474.144,67  KM po osnovu 1.151 rješenja (tabela broj 2).
• Povrati iz carinskog postupka
  Po osnovu više ili pogrešno uplaćenih sredstava u carinskom postupku Uprava je izvršila povrat u iznosu od 2.984.413,32 KM za 1.341 rješenje. Najveći broj rješenja donesen je po osnovu duplih uplata carinskoh dažbina, a manji broj po osnovu izmjena deklaracije i vraćanja robe u inostranstvo (tabela broj 2).
• Povrat poreza na promet po odluci Upravnog odbora UIO
  UO UIO donio je Odluku broj 240505/10 od 24.05.2005.godine po osnovu koje se u skladu sa prijedlogom entitetskih vlada, a po zahtjevima poreznih obveznika, vraća porez na promet za naftu nabavljenu tokom 2005. godine, a upotrebljenu kao repromaterijal u rudnicima i termoelektranama. Po tom osnovu izvršen je povrat poreza na promet u iznosu od 3.963.504,02 KM za 20 rješenja donesenih u 2006. godini (tabela broj 2).
• Povrati po osnovu rješenja donesenih od strane entitetskih kontrolnih organa
  U skladu sa članom 40.  Zakona o porezu na promet proizvoda i usluga i članom 56. Pravilnika o primjeni Zakona o porezu na promet proizvoda i usluga entitetske porezne Uprave i Uprava prihoda Brčko Distrikta bile su nadležne za kontrolu i obračun poreza na promet do 31.12.2005. godine, osim za uvozne proizvode. Shodno navedenom iste su bile nadležne da odlučuju o zahtjevima za povrat poreza na promet te donošenje rješenja o povratu više uplaćenih dažbina na jedinstveni račun. Po tom osnovu Uprava je zaprimila i izvršila 28 rješenja donesenih od strane entitetskih poreznih uprava u iznosu od 542.614,80 KM (tabela broj 2).
• Povrat po osnovu vraćenih neiskorištenih ili oštećenih poreznih markica
  U skladu sa članom 16. Pravilnika o poreznim markicama za duhanske prerađevine i kontrolnim markicama za alkoholna pića i vina, organizacione jedinice Uprave sačinile su i dostavile na izvršenje 22 rješenja o povratu akcize i poreza na promet po osnovu vraćenih i neiskorištenih ili oštećenih poreznih markica u Upravu u iznosu od 901.468,53 KM (tabela broj 2).

Stanje sredstava na računu rezervi u Centralnoj banci na dan 31.12.2006.godine iznosi 97.621.267,08 KM, i ta sredstva na računu minimalnih rezervi služe za izmirenje obaveza Uprave u vezi sa indirektnim porezima, po osnovu zahtjeva za povrat u narednom periodu.

• Pregled planiranih i ostvarenih prihoda na jedinstveni račun u periodu 01.01. - 31.12.2005/2006 godine
• Pregled naplaćenih prihoda na jedinstveni račun po vrstama u periodu 01.01. - 31.12.2006 godine